Тракайський костел не постраждав під час Другої світової війни, але найважливіші цінності з його скарбниці було вирішено сховати. Найцінніші артефакти були поховані всередині костелу. Серед них була велика монстранція та золоті корони ікони Божої Матері. Сховище відкрили у 1975 році під час реставрації. Частина скарбів Тракайського костелу сьогодні зберігається в Музеї церковної спадщини.

Зображення Пресвятої Діви Марії є одним з найдавніших і найбільш шанованих образів у Литві. Легенда свідчить, що це був подарунок візантійського імператора Великому князю Литовському Витаутасу. Розповіді про особливі благодаті та чудеса, пов'язані з цим зображенням, датуються початком 17 століття.